अनुयायियों या 1.4% आबादी के साथ नेपाल में पांचवां सबसे अधिक प्रचलित धर्म ईसाई धर्म है। हालाँकि, यह व्यापक रूप से दावा किया जाता है कि नेपाल के सेंसर में गैर- हिंदुओं को व्यवस्थित रूप से रिपोर्ट किया जाता है, और सूचित पर्यवेक्षकों ने अनुमान लगाया है कि कम से कम १ मिलियन नेपाली ईसाई हैं। गॉर्डन कॉन्वेल थियोलॉजिकल सेमिनरी की एक रिपोर्ट के अनुसार, नेपाल का चर्च दुनिया में सबसे तेजी से बढ़ रहा है। नेपाली ईसाइयों के विशाल बहुमत इंजील प्रोटेस्टेंट हैं^[1] (यदि इंजील को मोटे तौर पर करिश्माई और पेंटेकोस्टल शामिल करने के लिए परिभाषित किया गया है); लगभग १०,००० की एक छोटी कैथोलिक आबादी भी है। नेपाल में पहला ईसाई मिशन 1715 में कैथोलिक कैपुचिन फ्रार्स द्वारा स्थापित किया गया था, जिन्होंने काठमांडू घाटी में काम किया था। १9६9- ९, में नेपाल के एकीकरण के बाद कैपुचिन को निष्कासित कर दिया गया था और ईसाई समूहों को आधिकारिक तौर पर देश में अगली दो शताब्दियों के लिए प्रतिबंधित कर दिया गया था। 1951 की क्रांति के बाद, विदेशी मिशनरियों को सामाजिक सेवा कार्य करने के लिए नेपाल में प्रवेश करने की अनुमति दी गई थी, लेकिन मुकदमा चलाने और धर्मांतरण को अभी भी कानूनी रूप से प्रतिबंधित किया गया था। 1990 में बहुदलीय लोकतंत्र की शुरुआत के बाद, और धर्मांतरण पर प्रतिबंधों की छूट के बाद, नेपाली चर्च तेजी से विकसित होने लगा। ईसाई धर्म का विस्तार नेपाल में एक विवादास्पद विषय है, और नेपाली ईसाई छिटपुट हिंसा और व्यापक सामाजिक बहिष्कार के अधीन रहे हैं। नेपाली मीडिया और राजनीतिक प्रवचन में अक्सर यह दावा किया जाता है कि मिशनरियों को बदलने के लिए घटिया सामग्री प्रोत्साहन की पेशकश की जाती है,^[2] लेकिन शोध से संकेत मिला है कि अधिकांश नेपाली ईसाई मिशनरियों के संपर्क के अलावा अन्य कारणों से धर्मांतरण करते हैं।^[3]

1715 में कैथोलिक कैपुचिन मिशनरियों को काठमांडू घाटी में निवास करने की अनुमति दी गई थी। उन्होंने घाटी के तीन शहर-राज्यों में से प्रत्येक में काम किया, और अंततः अपना मुख्य आधार भक्तपुर में बनाया, जहाँ 1740 में बस गए थे। भक्तपुर के राजा, रणजीत मल्ल द्वारा उन्हें दिए गए गर्मजोशी से स्वागत से कैपुचिन आश्चर्यचकित थे, जिन्होंने लिखा, 'हमें सभी ने स्नेह से गले लगाया और हमारे साथ बहुत ही परिचित और विश्वास के साथ पेश आए ; उसने हमें अपने पास बैठाया और एक घंटे से अधिक समय तक रखा। ' मिशनरियों ने शाही दरबार पर अपनी गतिविधियों को केंद्रित किया, और राजा के लिए एकेश्वरवाद पर एक ग्रंथ की रचना की। हालाँकि वह परिवर्तित नहीं हुआ था, लेकिन राजा ने अपने कुछ विषयों को अपने स्थान पर ईसाई होने का प्रस्ताव दिया। कैपुचिन्स ने इस प्रस्ताव को अस्वीकार कर दिया, और, हालांकि वे स्वैच्छिक स्थानीय अभिसरणों की एक छोटी संख्या बनाने में सफल रहे, ९ में गोरखा के शासक पृथ्वी नारायण शाह द्वारा काठमांडू घाटी पर विजय प्राप्त करने के बाद उनके मिशन को समाप्त कर दिया गया। और सभी ईसाइयों को उसके नए राज्य से निकाल दिया।^[4] अगले 200 वर्षों में, 1951 तक, नेपाल पूरी तरह से ईसाइयों के लिए बंद था, हालांकि भारत से जातीय नेपाली इंजीलवादियों की छोटी संख्या सीमा पार करने में सक्षम थी। इनमें से सबसे प्रसिद्ध गंगा प्रसाद प्रधान (१32५१-१९३२), दार्जिलिंग में उठाया गया एक नवर है जिसे पहले संगठित नेपाली पादरी के रूप में जाना जाता है। प्रधान ने चर्च ऑफ़ स्कॉटलैंड मिशनरियों द्वारा दार्जिलिंग में चलाए जा रहे एक स्कूल में अध्ययन करते हुए ईसाई धर्म में परिवर्तित हो गए। उत्तरी भारत में नेपाली भाषी समुदाय के मंत्रालय के चालीस साल बाद, मुख्य रूप से नेपाली में एक बाइबल अनुवाद और अन्य प्रचार सामग्री बनाने पर ध्यान केंद्रित किया, उन्होंने 1914 में नेपाल में एक ईसाई उपस्थिति स्थापित करने के लिए अपने परिवार के साथ काठमांडू लौटने का फैसला किया। लगभग चालीस लोगों के एक समूह के साथ यात्रा करते हुए, प्रधान और उनके सहयोगियों की उपस्थिति अधिकारियों द्वारा जल्द ही काठमांडू पहुंचने के बाद पता चली। उन्हें दृढ़ता से छोड़ने का निर्देश दिया गया था, कहा जा रहा है: 'नेपाल में ईसाइयों के लिए कोई जगह नहीं है'।

हालाँकि नेपाली प्रोटेस्टेंटिज्म की तुलना में संख्यात्मक रूप से बहुत छोटा है, नेपाल में कैथोलिकवाद अपने शैक्षिक, पारस्परिक और सामाजिक सेवा कार्यों के माध्यम से महत्वपूर्ण प्रभाव डालता है। सेंट जेवियर्स स्कूल ने नेपाली अभिजात वर्ग की कई पीढ़ियों को शिक्षित किया है, जिसमें शाही परिवार के सदस्य और उच्च रैंकिंग वाले राजनीतिक, नौकरशाही और सैन्य अधिकारी शामिल हैं। २००१ से २००, तक नेपाल के राजा ज्ञानेंद्र शाह के बारे में कहा जाता है कि वे अपने पूर्व शिक्षक बिशप एंथोनी शर्मा एसजे दोस्ती करने के परिणामस्वरूप ईसाई धर्म के प्रति सकारात्मक रूप से दूर हो गए हैं, जबकि नेपाली प्रोटेस्टेंट सभी गैर-ईसाई से बचते हैं अनुष्ठान और समारोह, नेपाली कैथोलिक धर्म गैर-ईसाई धर्मों के लिए एक अधिक खुला दृष्टिकोण लेता है। कैथोलिक भाई तिका और दशीन, जैसे त्योहारों में भाग लेते हैं और कुछ जातीय समूहों के लिए शराब और सामाजिक और अनुष्ठानिक जीवन का एक महत्वपूर्ण हिस्सा हैं।